Karnik Gregorian wird in Giengen an der Brenz auf der Schwäbischen Alb geboren, wohin seine armenischen Eltern aus der Türkei als Gastarbeiter ausgewandert sind. Nach einem Auslandsaufenthalt in Paris beginnt er ein Studium der Sozialwissenschaften in Göttingen, das er in München an der Ludwig-Maximilians-Universität abschließt. Dort besucht er erfolgreich die Deutsche Journalistenschule. Schon während dieser Zeit arbeitet er als freier Journalist.
Seit 2001 realisiert Karnik Gregorian Dokumentarfilme u.a. ZIMMER MIT ANDACHT für die WDR-Reihe MENSCHEN HAUTNAH und führt Regie bei dem Dokumentarfilm DIE GERICHTE MEINES VATERS (ZDF/3Sat), für den er im In- und Ausland zahlreiche Festivalpreise (San Francisco, Yerevan, 
Stuttgart) bekommt. 2010 moderiert er die BR-Doku-Reihe HEIMATBILDER.
Karnik Gregorian ist seit 2007 auch als Videoartist an Theatern in Deutschland (z.B. Gorki Berlin, Thalia Hamburg, Schauspielhaus Bochum) und Österreich (Volkstheater) tätig und inszeniert selbst an Münchner Kammerspielen (MEET THE NEIGHBOURS, 24h und INSIDE LANDWEHRSTRASSE).